Tanınmış bir okul olan yatılı özel Cross Akademisi'nde gündüz ve gece dersleri bir arada bulunuyor. Gündüz derslerine sıradan öğrenciler devam ederken elit bir grup olan gececi öğrencilerin hepsi birer vampir!! Gündüzcüler için vampirlerin varlığı da gece derslerinin gerçek yüzü de kesinlikle bir sır. Bu büyük sırrı iki kişi korumakla görevli Yuki ve Zero onlar Akademinin Koruyucuları!! Gece sınıfının sınıf temsilcisi saf kan vampir olan Kaname ise bu önemli görevde Yuki ve Zero'nun en büyük destekçisi.

Yeni gelen gececi öğrenci Maria'yı gördüğü anda Zero nedenini bilemediği şiddetli bir içgüdünün etkisi altında kalır. Şüphe duymakta haklı olduğunu anlayınca da ona tabancasını doğrultur. Peki Maria gerçekte kimdir? Diğer yandan Maria'nın asıl yüzünü daha önce öğrenmiş olan Yuki Zero'yu kurtarmak için ne yapacak?