Sıradan bir lise son sınıf öğrencisi olan Hiyori eşofman giyen bir adamı kurtarmak için kendini otobüsün önüne atar. Kaza sırasında kurtardığı adam tanrısal bir silah arayışında olan başıboş bir tanrıdır...
Hiyori ile Yato Ilahi Silah arayışına işte böyle başlar...