Askerden dönünce köyünde duramayan Mustafa kendi işini kurmak için ailesiyle birlikte İstanbul'a taşınır.
Kısa zamanda hayal edemeyeceği bir seviyeye yükselen Mustafa çok geçmeden İstanbul'un renkli hayatına kendini kaptırır. Kitap bu aile fertlerinin şehirdeki günlük yaşamına sıkıntılarına ilgi alanlarına ve yıllar içinde yaşadıkları değişime tanıklık eder.
Ancak Mustafa ve ailesinin iyi günleri uzun sürmez. Kapitalizmin acımasız çarkları arasında bir anda her şeyini kaybeden küçük esnaf Mustafa bir dizi maceradan sonra kendisini bir tarikatın pençesinde bulur.
Tarikat içinde yaşadığı hadiseler Suriye'ye kadar uzanır. Geriye beş parasız darmadağın bir aile kalır.
Karanlık Menzil Anadolu'nun bir köyünden İstanbul'a taşınan sıradan bir ailenin hikayesini anlatırken; bir yandan da günümüzün yakıcı gerçeği olan tarikatların işleyişini insanları nasıl yanlarına çektiklerini ilişkiler ağını ve geçmişten günümüze geçirdikleri değişimleri en ince ayrıntısına kadar gözler önüne seriyor.