M.S. 4. Yüzyılda Roma İmparatorluğu'nun egemenliği altındaki Mısır'da... İskenderiye sokaklarındaki şiddetli dini ayaklanmalar şehrin ünlü kütüphanesine kadar yayılıyor. Kütüphanenin duvarları arasında tarihin gördüğü en parlak kişiliklerden biri olan astronom Hypatia ve öğrencileri Antik Dünya'nın bilgeliğini korumak için savaşıyorlar.
Destekçileri arasında Hypatia'nın kalbi için savaşan iki adam var. Engellenemeyen Hıristiyan yükselişine katılıp özgür kalmakla kalbi arasında kalan köle Davus ve imtiyaz sahibi zeki Orestes.