Balkanlar'da yaşanan çatışmanın en etkili iki unsuru olan Bulgar ve Rumlar arasındaki anlaşmazlık şüphe yok ki tarihi bir geçmişe dayanmaktadır. Bu tarihi anlaşmazlık 19. yüzyılda yayılan milliyetçi düşünceler ile yeniden ortaya çıkmıştır. Bulgarlar arasında gelişen milliyetçi düşünceler ile birlikte yüzlerce yıl önce sahip oldukları bağımsız kilise özlemi yeniden alevlenmiştir. Bu özlem ile Osmanlı hâkimiyeti altında idari manada bağlı oldukları Patrik- hane'ye karşı tepkiler meydana gelmeye başlamıştır. Rumlar ise Patrikhane aracılığı ile ellerinde bulunan gücü kullanarak Rum olmayan unsurları asimile etmeye çalışmıştır. Bütün bunlara yüzyılın son çeyreğinde yaşanan diğer siyasi olaylar da etkilenince çatışmanın boyutu daha farklı bir hal almıştır. Ulusal çıkarların sebep olduğu olaylara ayrıca mahalli sorunların da eklenmesi Balkanlar'da çözümü zor bir durum meydana getirmiştir. Ayrıca ulusal yapılanmalar içinde yer alan diğer unsurlar da çatışmadan çeşitli şekillerde etkilenmiş ya da içerisinde yer almıştır.